Gromadząc braci z szerokiego spektrum przynależności kościelnej, kulturowej i geograficznej Wspólnota realizuje powołanie, by być znakiem jedności w Kościele i rodzinie ludzkiej. „Bądź pomiędzy braćmi znakiem miłości braterskiej. (...) Nigdy nie pogódź się z gorszącym faktem podziału chrześcijan, którzy tak ochoczo wyznają miłość bliźniego, a pozostają podzieleni. Umiłuj gorąco jedność Ciała Chrystusowego.” (Reguła Taizé)

Zanim Brat Roger przybył do Taizé w 1940 roku, jako młody student wziął udział w pierwszym ekumenicznym spotkaniu młodych ludzi, które w 1939 roku ściągnęło do Amsterdamu 1500 delegatów z 70 krajów. Od początku istnienia Wspólnoty bracia wnosili swój wkład w ekumeniczną refleksję teologiczną, szczególnie w ramach „Groupe des Dombes” zrzeszającej kraje frankofońskie oraz „Faith and Order” działającej na poziomie międzynarodowym. W 1960 roku, w ramach wsparcia przygotowań do Soboru Watykańskiego II, w Taizé na wspólnej konferencji zgromadzili się biskupi katoliccy i pastorzy protestanccy.

Począwszy od lat sześćdziesiątych ubiegłego stulecia do Taizé zaczęły przyjeżdżać coraz liczniejsze grupy młodych ludzi różnych wyznań. Ich obecność stymuluje ekumeniczne zaangażowanie Wspólnoty. Wiele głów Kościoła przybywa do Taizé na krótszy lub dłuższy czas, by modlić się i rozmawiać z braćmi oraz młodymi ludźmi: papież Jan Paweł II w 1986 roku, patriarcha ekumeniczny Bartłomiej I, arcybiskup Konstantynopola w 2017 roku, czterech anglikańskich biskupów Canterbury, wszyscy biskupi luterańscy Kościoła Szwecji oraz wielu pastorów i biskupów z całego świata.

Kolejne etapy „pielgrzymki zaufania” organizowanej przez braci są również przejawem ich pasji budowania jedności. Spotkania odbywające się poza Taizé, zwłaszcza Europejskie Spotkanie Młodych pod koniec każdego roku, przygotowywane są w miarę możliwości z udziałem wszystkich chrześcijan z danego miasta lub regionu. Wspólne modlitwy i oferowana gościnność dają przedsmak tego, jak mógłby wyglądać zjednoczony Kościół w całej swej ogromnej różnorodności.

Z okazji niedawnego synodu o synodalności w Kościele Katolickim Wspólnota Taizé zaproponowała i wspomogła organizację „zgromadzenia Ludu Bożego” w Rzymie. 23 września 2023 roku ekumeniczne czuwanie modlitewne „Together” zgromadziło na Placu Świętego Piotra 18.000 uczestników, a błogosławieństwa udzielił im papież Franciszek wraz z dziewiętnastoma zwierzchnikami kościołów różnych wyznań. .